Detalhe da pesquisa
1.
A cryptic plasmid is among the most numerous genetic elements in the human gut.
Cell
; 187(5): 1206-1222.e16, 2024 Feb 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38428395
2.
Gene Expression Changes and Community Turnover Differentially Shape the Global Ocean Metatranscriptome.
Cell
; 179(5): 1068-1083.e21, 2019 Nov 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31730850
3.
Functional and evolutionary significance of unknown genes from uncultivated taxa.
Nature
; 626(7998): 377-384, 2024 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38109938
4.
Biosynthetic potential of the global ocean microbiome.
Nature
; 607(7917): 111-118, 2022 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35732736
5.
SPIRE: a Searchable, Planetary-scale mIcrobiome REsource.
Nucleic Acids Res
; 52(D1): D777-D783, 2024 Jan 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37897342
6.
mBARq: a versatile and user-friendly framework for the analysis of DNA barcodes from transposon insertion libraries, knockout mutants, and isogenic strain populations.
Bioinformatics
; 40(2)2024 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38341646
7.
mTAGs: taxonomic profiling using degenerate consensus reference sequences of ribosomal RNA genes.
Bioinformatics
; 38(1): 270-272, 2021 12 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34260698
8.
Multi-omics data integration reveals novel drug targets in hepatocellular carcinoma.
BMC Genomics
; 22(1): 592, 2021 Aug 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34348664
9.
Impact of manipulation of glycerol/diol dehydratase activity on intestinal microbiota ecology and metabolism.
Environ Microbiol
; 23(3): 1765-1779, 2021 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33587772
10.
Bioinformatics for precision oncology.
Brief Bioinform
; 20(3): 778-788, 2019 05 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29272324
11.
NGS-pipe: a flexible, easily extendable and highly configurable framework for NGS analysis.
Bioinformatics
; 34(1): 107-108, 2018 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28968639
12.
Gut microbial beta-glucuronidase and glycerol/diol dehydratase activity contribute to dietary heterocyclic amine biotransformation.
BMC Microbiol
; 19(1): 99, 2019 05 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31096909
13.
Intestinal Dysbiosis, Barrier Dysfunction, and Bacterial Translocation Account for CKD-Related Systemic Inflammation.
J Am Soc Nephrol
; 28(1): 76-83, 2017 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27151924
14.
MEGAN Community Edition - Interactive Exploration and Analysis of Large-Scale Microbiome Sequencing Data.
PLoS Comput Biol
; 12(6): e1004957, 2016 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27327495
15.
Endotoxicity of lipopolysaccharide as a determinant of T-cell-mediated colitis induction in mice.
Gastroenterology
; 146(3): 765-75, 2014 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24269927
16.
Integrative analysis of environmental sequences using MEGAN4.
Genome Res
; 21(9): 1552-60, 2011 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21690186
17.
Niche availability and competitive loss by facilitation control proliferation of bacterial strains intended for soil microbiome interventions.
Nat Commun
; 15(1): 2557, 2024 Mar 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38519488
18.
Phenology and ecological role of aerobic anoxygenic phototrophs in freshwaters.
Microbiome
; 12(1): 65, 2024 Mar 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38539229
19.
From microbiome composition to functional engineering, one step at a time.
Microbiol Mol Biol Rev
; 87(4): e0006323, 2023 Dec 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37947420
20.
Diversity of the Pacific Ocean coral reef microbiome.
Nat Commun
; 14(1): 3039, 2023 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37264002